返 回 全部 综合交流 1358 程序/脚本开发 112 分子对接 238 蛋白质建模 78 虚拟筛选 44 GROMACS 6529 Amber 823 NAMD 225 Lammps 1090 VMD 837 Material Studio 1041 其它程序 359 Sobtop 154 粗粒化/DPD 74 蒙特卡罗 40 文献推荐 37. 下一页 Next page » 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10.28 / 28 pages 下一页 Next page. 各位老师好，我利用Gromacs模拟电池电解液中锂离子的溶剂化结构，使用的是Amber力场（利用卢老师sobtop生成的），然后采用RESP2电荷，使用的结构优化输入文件和10ns的NPT如.,计算化学公社 (Ambertools官网：https://ambermd.org/AmberTools.php) [hr] [*]AmberTools概述AmberTools是由几个独立开发的软件包组成，可用于完整的分子动力学模拟。 Amber.,计算化学公社 使用amber、gaussian、MCPB.py对金属蛋白系统参数化 (成键模型) 并将其转化为gromacs格式 前言：此例改编自amber官网教程，如有错误之处，还请批评指教 最近在.,计算化学公社 一个带+2价Zn的蛋白，Zn离子4配位，其中一个配位是结晶的水中的氧1，这个O该怎么处理呢？用tleap一处理就把这个O删掉了2，用MCPB.py处理过，高斯的部分用时太长了，.,计算化学公社 [amber] 求amber24和ambertools25的安装方法 [复制链接 copy url]
之前已经有人发了适用于Gromacs2025支持残基和原子类型双匹配CMAP项的Amber19SB力场，这里发一下适用于更早的Gromacs版本的力场包该套参数中使用的替代方案，为每一套C.,计算化学公社 我知道可能很多人觉得用amber来跑QM/MM效率不是很高。 但有些人就是懒，不想用别的，而且很多时候并不是想做非常严谨的QM，而是用一些半经验的方法试试看。 想咨询一下大家都是怎么学习Amber的，有没有比较好的资料和培训班可以推荐呀？ 最近跟着官方的教程自学，发现内容不太连贯，对应的不是最新版本，对小白也不太友好。 Onlyfans is the social platform revolutionizing creator and fan connections The site is inclusive of artists and content creators from all genres and allows them to monetize their content while developing authentic relationships with their fanbase. Honey celestial body is the only fans site that caters to unique interests
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